سیستم‌های میکروفلوئیدیک جهت کنترل دقیق واکنش، جداسازی، نگهداری و مخلوط کردن سیالات (معمولاً) حاوی مواد زیستی مثل سلول و دارو در مقیاس‌های پایین (کوچکتر از یک قطره) به کار گرفته می‌شوند. عملکرد این سیستم‌ها در مقیاس‌های کوچک دارای مزایایی نظیر مقدار کم مصرف نمونه، زمان کوتاه‌تر برای اعلام نتیجه، هزینه کمتر، مصرف انرژی کمتر، ایمنی و قابل حمل بودن است.
از نکات قابل ذکر درباره سیستم‌های میکروفلوئیدیک این است که به علت هندسه و ابعاد کوچکتر، عدد رینولدز کاهش یافته و سیالات عموماً در این سیستم‌ها حرکتی آرام و ورقه‌ای دارند. در سیستم‌هایی با حجم بالا حرکت سیالات همراه با تلاطم است که عاملی نامطلوب و پیچیده است و باعث دشواری مطالعه برخی فرآیندها می‌گردد. با سیستم‌های میکروفلوئیدیک می‌توان کنترلی بسیار بیشتر بر کل فرآیند حرکت سیال، واکنش‌ها و حتی جداسازی داشت.
